La Biblioteca "Parmenio Yañez A.", la cual lleva el nombre del primer Director y fundador de la Estación de Biología Marina, hoy Facultad de Ciencias del Mar y de Recursos Naturales, forma parte del Sistema Integrado de Bibliotecas de la Universidad de Valparaíso, SIBUVAL.
Asiste, principalmente, a docentes y alumnos de la carrera de Biología Marina y a los programas de Magíster en Oceanografía y Doctorado en Ciencias: con mención en recursos naturales acuáticos.
A la fecha, la biblioteca se ha enriquecido principalmente, por el canje de la Revista de Biología Marina y Oceanografía, publicada por la institución desde 1948, a valiosas donaciones provenientes del país y del exterior y a las adquisiciones de los aportes de proyectos concursables.
Dentro de sus colecciones se destaca: Expediciones científicas, Publicaciones Periódicas extranjeras y nacionales, cartas naúticas , publicaciones de organizaciones internacionales como UNESCO y FAO y Obras destacadas como ejemplo: Fauna Chilena, Carcinología Chilena, Le Regne Animal, etc.
Además es miembro de International Association of Aquatic and Marine Science Libraries and Information (IAMSLIC), lo cual permite acceder a artículos y capítulos de revistas y libros no disponibles en biblioteca.
Existen acuerdos de cooperación con bibliotecas chilenas del área de Ciencias del Mar, unidas en el Grupo de Información Marina perteneciente al CONA. Grupo conformado por representantes de la, Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Servicio Hidrográfico y Oceanográfico de la Armada, Instituto de Fomento Pesquero, Museo de Historia Natural, Instituto Antártico Chileno, entre otras.
Se encuentra disponible para toda la comunidad Universitaria, las bases de datos internacionales Electronic Journals Service ( EBSCO), ISI Web of Knowledge que indexa revistas de corriente principal en el mundo, Scielo Chile, Biblioteca Electrónica de Información Científica (BEIC) la que permite acceder al texto completo de más de cinco mil títulos de revistas de corriente principal de los siguientes editores: Elsevier (Science Direct), Springer, Blackwell, Wiley, American Chemical Society (Web Edition), Annual Reviews, Oxford University Press y Nature Publishing Group.
Hoy cuenta con más de 4000 títulos de libros en Ciencias Básicas y especializados en Biología Marina y Oceanografía los cuales se encuentran a disposición de los docentes y alumnos a través del préstamo automatizado y conexión en línea con SIBUVAL.